Η Δ.Ε.Υ.Κ.Α διοικείται απο εννεαμελές Διοικητικό Συμβούλιο, η θητεία του οποίου είναι παράλληλη με την θητεία του Δημοτικού Συμβουλίου και ορίζονται μαζί με τους αναπληρωτές τους από το Δημοτικό Συμβούλιο του Δήμου.
Από τα έντεκα μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου:
α) Έξη ( 8) είναι οι αιρετοί εκπρόσωποι της Δημοτικής Αρχής εκ των οποίων ο ένας θα προέρχεται από τη μειοψηφία του Δημοτικού Συμβουλίου Κύμης−Αλιβερίου
β) Ένας (1) είναι δημότης του Δήμου Κύμης−Αλιβερίου που έχει πείρα ή γνώσεις σχετικές με το αντικείμενο της επιχείρησης
γ) Ένας ( 1 ) είναι εκπρόσωπος Κοινωνικού φορέα της περιοχής.
δ) Ένας ( 1 ) είναι εκπρόσωπος του σωματείου των εργαζομένων.
Η οργάνωση και η λειτουργία της επιχείρησης διέπεται βασικά από το Ν. 1069/1980, τον οργανισμό εσωτερικής υπηρεσίας και από κανονισμούς λειτουργίας και διαχείρισης.